基因突变阻止了原本相同大小的X和Y染色体间的大量交换。缺乏 沟通 的它们开始分道扬镳，各自产生更多突变，因失去交换而产生的差异越来越大。最终，X和Y染色体各自发展出不同的性别特征基因。Y染色体上对雄性有利的基因对雌性却常有坏处；反之X染色体上对雌性有利的基因总是打压雄性特征。一旦它们 打起来 ，就会影响人体性征。例如，X染色体上的DAX基因遇上Y染色体上的Sry基因时，如果是1v1，Sry占上风，男性性征正常；但当X染色体上出现两份DAX基因时，Sry无力还手，XY男性表现的会更像女性。

在漫长的进化过程中，当XX和XY相遇时，3/4的X战斗力远超1/4的Y。和而不同的大背景下，Y染色体受到X染色体的 选择与攻击 ，最后Y染色体删除了 不被接纳 的片段，变得越来越短。当X染色体拒绝修复Y的创伤时，Y染色体开始顽强自保，在自己仅有的领地构建 镜像世界 ，形成大量回文结构，备份已有的遗传信息。当自己的某个基因不幸突变时，通过将自己弯起来，进行重组互换，修复突变。缺兄少弟的Y染色体逐渐 猥琐发育 ，变得功能专一，更专注于雄性发育。

图2 Y染色体通过回文结构进行重组与互换（图源：者说）

Y染色体的 萎靡不振 让生物学家们担心其会在不久的将来彻底消失。研究Y染色体的权威专家David C. Page甚至在他的茶杯上亲自写下 拯救男性 。2015年10月24日，在国际基因组学大会上，来自澳大利亚拉筹伯大学（La Trobe University）分子科学研究所的Jennifer Graves教授表示，Y染色体可能会在450万年后彻底消失。这一观点的依据是Y染色体每百万年减少10个基因，以此类推，不需要500万年，Y染色体就不复存在。研究发现当Y染色体上Sry基因也缺失的时候，决定男性特征的睾丸就不会再发育。除了Sry基因外，Y染色体上其他基因的缺失，也会引起整个哺乳动物群体的生长发育失调。