来源:生物世界 2024-08-07 10:07
通过优化连接氨基酸、引入具有合成倾向性的DNA聚合酶,还可以进一步提高编辑效率与编辑纯度。全面评估显示,TBE在基因组或转录组水平上都不会导致严重的脱靶编辑,这表明其具有高度的编辑特异性。北京大学魏文胜团队在Nature Communications期刊发表题为:Programmable DNA pyrimidine base editing via engineered uracil-DNA glycosylase的研究论文。
该研究开发了一种不依赖脱氨酶的DNA碱基编辑器 TBE(Thymine base editor),与现有的其他胸腺嘧啶编辑工具相比,TBE表现出更高的编辑效率、更小的细胞毒性和更低的脱靶现象。
研究团队关注到人源化尿嘧啶DNA-糖基化酶(hUNG)的两个突变体可以在体外实现对胞嘧啶和胸腺嘧啶的直接切割。因此,通过将hUNG突变体与Cas9蛋白结合,sgRNA靶向编辑位点可以在体内实现对DNA序列中的C和T的直接编辑(图1),其中在报告系统上编辑C的效率可达到30%,与现存的CGBE编辑效率类似,但针对T的hUNG突变体编辑效率较低。