肿瘤微环境严重影响了肿瘤的进展和对于治疗的响应。应用单细胞转录组技术，张泽民院士组针对多个癌种、多种肿瘤浸润免疫细胞类型建立了单细胞图谱，发现了包括肿瘤响应T细胞【1】、SPP1+巨噬细胞【2】、LAMP3+树突状细胞【3】等与相关的重要细胞亚型。

作为一种常见肿瘤得到了广泛的关注，基于基因组和bulk层面转录组的分子分型揭示了结直肠癌病人间的高度异质性【4,5】。一些研究试图将这些分子分型与肿瘤微环境特征相联系，发现肿瘤微环境在同一个组内的病人中仍然具有较大的差异【6,7】，说明现有的结直肠癌分子分型并不能很好的反映肿瘤微环境的个体间异质性。

2024年8月15日，张泽民院士团队在Nature Cancer在线发表题为Integrative single-cell analysis of human colorectal cancer reveals patient stratification with distinct immune evasion mechanisms的研究论文。研究团队通过整合已公开的来自将近200个体的结直肠组织的超过60万个单细胞转录组数据，建立了包括健康、肠炎、肠道息肉、癌旁和肿瘤组织的单细胞图谱。