在生命科学研究中,探究基因的功能是解码生命奥秘的核心任务之一。然而,这项工作往往面临一个关键挑战:如何地比较携带突变基因的细胞与正常细胞的生物学差异。在传统研究中,研究人员通常通过独立的实验对象(如不同的实验动物)进行比较,然而,这种方法不可避免地受到外部因素如环境、表观遗传改变及组织微环境差异的影响,从而降低研究结果的精确性和可信度。
为解决这一难题,遗传马赛克技术应运而生。通过在同一实验个体中同时生成突变和正常细胞,这一技术允许研究人员在相同的生物背景下比较细胞间的差异。然而,现有技术如CreERT2依赖的马赛克诱导方法,虽然应用广泛,却存在标记精确度低、假阳性和假阴性频率高的问题。此外,这些方法难以在同一组织微环境中同时标记突变和野生型细胞,限制了其在单细胞水平上的研究潜力。
为应对这些挑战,12月13日 Nature Methods的研究报道 iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells ,开发了一种革命性的新工具 iFlpMosaics。该工具结合了Flp重组酶技术和多光谱荧光标记技术,通过对细胞进行精确的基因操控和标记,实现了突变细胞与野生型细胞在同一微环境中的共存和分析。与传统方法相比,iFlpMosaics不仅能够提高实验的准确性和重复性,还能实现对单细胞水平基因功能的深度解析。这一创新工具的问世,为研究基因功能及其在组织发育、稳态和疾病中的作用提供了强大的技术支持。
通过iFlpMosaics,研究人员可以利用荧光成像、流式细胞术(FACS)以及单细胞RNA测序等方法,对突变细胞与野生型细胞进行高通量比较分析。该技术的出现,不仅为理解基因突变如何影响细胞生物学奠定了基础,还为揭示复杂疾病的病因提供了全新的研究视角。