来源:生物世界2022-11-07 15336006
本研究利用多组学技术发现了一组由长链非编码RNA(lncRNA)编码的多肽是p53信号通路的新成员,并揭示了这些多肽在p53信号通路中的功能和调控网络。
TP53(p53)是最重要的肿瘤抑制因子,对维持细胞基因组的完整性至关重要。为了应对DNA损伤,p53蛋白被激活并作为转录因子来调节大量蛋白质编码基因、mirna和长链非编码RNA(lncRNA)的表达。在前期研究中,我们发现了p53调控的LTR反转录转座子衍生的lncRNA(LTR-lncRNA)促进DNA同源重组和修复的新功能。
有趣的是,最近的研究发现,一些lncRNA可以进一步编码肽(小肽)在重要的生理和病理过程中发挥调节作用。然而,p53调控的lncRNA能否编码多肽并作为多肽发挥重要的生物学功能仍有待阐明。
最近,中山大学生命科学学院杨建华教授/曲良虎教授研究组在《基因组生物学杂志》上发表了一篇题为:TP53-工业上推定的长非编码RNAs编码抑制细胞增殖的功能多肽s的研究论文。
本研究利用多组学技术发现了一组由长链非编码RNA(lncRNA)编码的多肽是p53信号通路的新成员,并揭示了这些多肽在p53信号通路中的功能和调控网络。
研究团队通过构建DNA损伤修复细胞模型,结合Ribo-seq、RNA-seq、CRISPR/Cas9和RNA组学分析,系统鉴定了人类细胞中受p53调控的300多个lncRNA和200多个具有编码潜力的lncRNA(图1)。
图1:通过联合蛋白质组学技术鉴定p53调节的具有编码潜力的lncRNA
本研究随机选取一批lncRNA进行实验验证,确认了p53调控的lncRNA编码的15种多肽。此外,通过使用各种质谱技术(鸟枪法MS、PRM MS和MRM MS)和抗体制备技术,发现许多多肽在人类细胞中内源性表达。
进一步的功能丧失和获得实验表明,p53调控的TP53LC02和TP53LC04多肽可以抑制多种癌细胞的增殖,并且多肽分子代替lncRNA分子发挥作用。本研究还证明了TP53LC04多肽可以通过调节细胞周期参与p53介导的肿瘤抑制。这项研究揭示了lncRNA编码的多肽在p53调控网络中的新作用(图2),扩大了人们对p53调控网络的了解,并为有效的癌症治疗提供了新的潜在靶点。
图2:2:p53调节的lncRNA编码的多肽在癌细胞增殖中的功能
杨建华教授、曲良虎教授、特聘副教授、暨南大学何清玉教授为论文合著者,许、博士、博士、妙林法师彭辉为论文合著者。本研究得到了国家重点科技攻关项目的资助。d计划和其他国家项目。
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