中国科学院上海巴斯德研究所研究员Daniel Falush与挪威奥斯陆大学合作，《自然-通讯》 (Nature Communications)发表演讲。在线发表了一篇名为《外来突变替换驱动下的幽门螺杆菌反复走出非洲扩增》的研究论文，报告了幽门螺杆菌几个走出非洲并逐渐取代欧洲和中东本土谱系的非洲新谱系的独特进化史。这项研究证实了走出非洲过程中瓶颈效应导致的有害突变积累是后续迁移和替换其他地区本地谱系的原因。

幽门螺杆菌是一种寄生在人体胃部的细菌，是世界上感染率较高的细菌之一。幽门螺杆菌感染可引起慢性胃炎和溃疡，并显著增加风险。过去一般认为幽门螺杆菌与其宿主人类有着相似的进化史，它是通过5万年前人类祖先的一次走出非洲的事件传播到世界各地的。

这项研究分析了来自非洲、欧洲和亚洲的幽门螺杆菌的基因组序列，发现至少有三个独立的非洲外事件。进一步的研究表明，在相同的遗传多样性水平下，与非洲菌株相比，欧亚菌株积累了更多的非同义突变，这证明了来自非洲的第一次迁徙对细菌的适应性产生了重要影响。欧洲毒株作为杂合子，缺少亚洲血统，说明这部分血统在随后的基因融合过程中被替换。

研究表明，尽管幽门螺杆菌依赖于人类传播，但其DNA传播模式与人类DNA不同。这项研究证明，重要的种群事件(如走出非洲)影响细菌的适应性和种群动态变化模式。

幽门螺杆菌hpEurope株的家系组成